RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 GASTP01350 101 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 GYPEP15421 78 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC184Q52MB2 194 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 TSPYL6Q8N831 410 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF480Q8WV37 535 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 LOXL4Q96JB6 756 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 SLC2A13Q96QE2 648 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 NCDNQ9UBB6 729 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 RTL9Q8NET4 1388 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 DUOX1Q9NRD9 1551 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF609O15014 1411 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CACNA1SQ13698 1873 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 YDJCA8MPS7 323 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 AKR1B10O60218 316 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 NDUFS2O75306 463 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ALDH1L1O75891 902 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 IGKV5-2P06315 115 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 GPSM2P81274 684 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PPP3CAQ08209 521 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ICAM4Q14773 271 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 MST1LQ2TV78 715 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 TBC1D16Q8TBP0 767 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 Q8TCH9 128 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 TEKT5Q96M29 485 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CD248Q9HCU0 757 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 POLLQ9UGP5 575 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ECE2O60344 883 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 C5AR1P21730 350 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CRHR1P34998 444 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 WASP42768 502 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 FOXL1Q12952 345 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ARL8AQ96BM9 186 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PCNTO95613 3336 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 XDHP47989 1333 aa7.52□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PSMD14O00487 310 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 UFL1O94874 794 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 COMTP21964 271 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ECHS1P30084 290 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MAP2K2P36507 400 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CASRP41180 1078 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MMP14P50281 582 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MGAT2Q10469 447 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 HS1BP3Q53T59 392 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM240Q5SV17 173 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CST9Q5W186 159 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MFSD5Q6N075 450 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 PPM1NQ8N819 430 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 AGBL3Q8NEM8 1001 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CHST13Q8NET6 341 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 LINS1Q8NG48 757 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 BORCS6Q96GS4 357 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 DBNDD1Q9H9R9 158 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 BCO1Q9HAY6 547 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 LTBP1Q14766 1721 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 FOXN1O15353 648 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ITGA10O75578 1167 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CSF1RP07333 972 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 GZMKP49863 264 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 SLC16A1P53985 500 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 EFEMP1Q12805 493 aa7.51□□□□□ -1.21
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