RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514815.1

PAPSS1-208, Transcript of 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, human

TSL 5

Gene PAPSS1, Length 296 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPSS1-208	ENST00000514815	NRP1	O14786	923 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	CYP11A1	P05108	521 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	GALT	P07902	379 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	PAEP	P09466	180 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ODC1	P11926	461 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	GNA15	P30679	374 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	BRCC3	P46736	316 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	RAD23B	P54727	409 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	CDR2	Q01850	454 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	CCDC42	Q96M95	316 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	NME7	Q9Y5B8	376 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815		I3L4J1	428 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	GABRD	O14764	452 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	AKR1B10	O60218	316 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	NDUFA10	O95299	355 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ALDH2	P05091	517 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	CHRNB2	P17787	502 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	TYMP	P19971	482 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	BCAR1	P56945	870 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	DEF6	Q9H4E7	631 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	DSE	Q9UL01	958 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815		A0A087X0T9	212 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	LCA5L	O95447	670 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	CALCA	P01258	141 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	FAM228B	P0C875	321 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	LAG3	P18627	525 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	PBX3	P40426	434 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	LHX1	P48742	406 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	FMO1	Q01740	532 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ORC1	Q13415	861 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	SLC18A3	Q16572	532 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ZNF263	O14978	683 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	SYN3	O14994	580 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	THAP12	O43422	761 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	HCRT	O43612	131 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	TADA2A	O75478	443 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	EFEMP2	O95967	443 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	MME	P08473	750 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	VDR	P11473	427 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	CD19	P15391	556 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	TNFAIP3	P21580	790 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PAPSS1-208	ENST00000514815	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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