RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 SEC24CP53992 1094 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 PIGFQ07326 219 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 DYRK1AQ13627 763 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 ODR4Q5SWX8 454 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 LNX2Q8N448 690 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 Q96MF0 132 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 MADDQ8WXG6 1647 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 ERICH3Q5RHP9 1530 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 E9PLN8 166 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 AP1G1O43747 822 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 SUN1O94901 812 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 MATN4O95460 622 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 ALDH2P05091 517 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 BMP5P22003 454 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 FDXRP22570 491 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 IL12RB1P42701 662 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 HSPA2P54652 639 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 FPGSQ05932 587 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 TCF15Q12870 199 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 FOXI1Q12951 378 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 GEN1Q17RS7 908 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 TPH2Q8IWU9 490 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 POC1BQ8TC44 478 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 SLC9A6Q92581 669 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 CAVIN3Q969G5 261 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 CGRRF1Q99675 332 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 CDYLQ9Y232 598 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 BCORL1Q5H9F3 1711 aa5.84□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 H3BML4 177 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 H3BUI4 141 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 SRGNP10124 158 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 RARBP10826 455 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 MPP3Q13368 585 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 PLS1Q14651 629 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 EMC10Q5UCC4 262 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 TRIB1Q96RU8 372 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 SMOQ99835 787 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 SIK2Q9H0K1 926 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 CASS4Q9NQ75 786 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 DMTF1Q9Y222 760 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.83□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 A0A088AWK7 358 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 GATA3P23771 443 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 ADRA1BP35368 520 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 CCDC157Q569K6 752 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 Q6ZNX1 250 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 MICALCLQ6ZW33 695 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 DNAJC10Q8IXB1 793 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 SLC35A4Q96G79 324 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 INTS13Q9NVM9 706 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 ETAA1Q9NY74 926 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.82□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF785A8K8V0 405 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 PROM1O43490 865 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 PLA2G5P39877 138 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-220ENST00000512069 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.81□□□□□ -1.48
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