RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF516Q92618 1163 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 FGF13Q92913 245 aa20.14■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 CORO1BQ9BR76 489 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.14■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.13■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.12■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 SURF1Q15526 300 aa20.12■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.12■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH7Q9ULB5 785 aa20.12■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 ATF6P18850 670 aa20.11■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 DLG4P78352 724 aa20.11■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 HPDLQ96IR7 371 aa20.11■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.811e-6■■■□□ 16.2
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SH3BP2-218ENST00000511185 ANHXE9PGG2 379 aa20.1■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 TDGQ13569 410 aa20.1■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 HUS1O60921 280 aa20.09■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 CEP135Q66GS9 1140 aa20.09■□□□□ 0.81
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SH3BP2-218ENST00000511185 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 KXD1Q9BQD3 176 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC3Q9BY71 257 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-218ENST00000511185 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.08■□□□□ 0.81
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