RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	LATS1	O95835	1130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PDHA1	P08559	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PRR35	P0CG20	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	CHRM3	P20309	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	MAL	P21145	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	DRD4	P21917	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PCSK6	P29122	969 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	CCT8	P50990	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	VPS4B	O75351	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TTLL1	O95922	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	NDUFV1	P49821	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	GRM1	Q13255	1194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ODF1	Q14990	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	REPS1	Q96D71	796 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP34-222	ENST00000498268	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	GJB1	P08034	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	MYBL2	P10244	700 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	MPG	P29372	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SLC16A1	P53985	500 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	TBCC	Q15814	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ZNF213	O14771	459 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	KIF20A	O95235	890 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ANXA1	P04083	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SP2	Q02086	613 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ETFDH	Q16134	617 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	TISP43	B9A030	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	PPM1D	O15297	605 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	TRIAP1	O43715	76 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	KEL	P23276	732 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	MTMR1	Q13613	665 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USP34-222	ENST00000498268	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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