RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493427.1

ABCD4-215, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-215	ENST00000493427	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCD4-215	ENST00000493427	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	PFKFB2	O60825	505 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	SCRN1	Q12765	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	HES2	Q9Y543	173 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	SPG11	Q96JI7	2443 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	BSN	Q9UPA5	3926 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	MYLK	Q15746	1914 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	LARGE1	O95461	756 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	JUP	P14923	745 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	ELF1	P32519	619 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	SREBF1	P36956	1147 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	GALK1	P51570	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	NEK4	P51957	841 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	RTP5	Q14D33	572 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	EXD3	Q8N9H8	876 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	TSC1	Q92574	1164 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	HPS4	Q9NQG7	708 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	IPP	Q9Y573	584 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	MTOR	P42345	2549 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427		A0A1W2PRU2	124 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	CPLX1	O14810	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	AP5Z1	O43299	807 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	DTNB	O60941	627 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	PRKCB	P05771	671 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	ACTN2	P35609	894 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	HNF1B	P35680	557 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF33A	Q06730	810 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	VAC14	Q08AM6	782 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	ME3	Q16798	604 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	PTPRN	Q16849	979 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	CEP72	Q9P209	647 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	DEXI	O95424	95 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	SEC24A	O95486	1093 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	PRAMEF12	O95522	483 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	GNA11	P29992	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	EPHA5	P54756	1037 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	ROR1	Q01973	937 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	NPY5R	Q15761	445 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	KNL1	Q8NG31	2342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCD4-215	ENST00000493427	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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