RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493152.6

SUCLA2-208, Transcript of succinate-CoA ligase ADP-forming beta subunit, human

TSL 3

Gene SUCLA2, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLA2-208	ENST00000493152	SLC6A4	P31645	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	PIF1	Q9H611	641 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	PDE8A	O60658	829 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	SLC43A1	O75387	559 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	CDC45	O75419	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	ANXA1	P04083	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	RHO	P08100	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZNF134	P52741	427 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	MC2R	Q01718	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	TBCC	Q15814	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	QSOX1	O00391	747 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	SOCS2	O14508	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	SOAT2	O75908	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SUCLA2-208	ENST00000493152		A0A087X0B3	334 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	SCP2	P22307	547 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	ID4	P47928	161 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	NDUFV1	P49821	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	REPS1	Q96D71	796 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	BRINP1	O60477	761 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	TWIST1	Q15672	202 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	DPF2	Q92785	391 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	MARK4	Q96L34	752 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	FGB	P02675	491 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	SBK3	P0C264	359 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	WAS	P42768	502 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	MTNR1B	P49286	362 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	STRN3	Q13033	797 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	OSM	P13725	252 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	JUP	P14923	745 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	ITGAL	P20701	1170 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	GPR3	P46089	330 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	LRRC41	Q15345	812 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SUCLA2-208	ENST00000493152	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69

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