RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 STK33Q9BYT3 514 aa9.19□□□□□ -0.94
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PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 PIP5K1CO60331 668 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CHKAP35790 457 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 VIPR2P41587 438 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ALDH9A1P49189 494 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SATB1Q01826 763 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 FOXL1Q12952 345 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ELF2Q15723 593 aa9.18□□□□□ -0.94
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PTPRC-212ENST00000491302 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
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PTPRC-212ENST00000491302 DNERQ8NFT8 737 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 OR56A3Q8NH54 315 aa9.18□□□□□ -0.94
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PTPRC-212ENST00000491302 IL1R2P27930 398 aa9.17□□□□□ -0.94
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PTPRC-212ENST00000491302 CSRP2Q16527 193 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.17□□□□□ -0.94
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PTPRC-212ENST00000491302 MB21D1Q8N884 522 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 PNKPQ96T60 521 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SMOQ99835 787 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM233B4DJY2 109 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 E9PLN8 166 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRC-212ENST00000491302 IDEP14735 1019 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 IL1R1P14778 569 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 HK1P19367 917 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 FDXRP22570 491 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CCT5P48643 541 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 PTTG1IPP53801 180 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF844Q08AG5 666 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRC-212ENST00000491302 FUKQ8N0W3 1084 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SYT8Q8NBV8 401 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.16□□□□□ -0.94
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PTPRC-212ENST00000491302 MAGEB5Q9BZ81 275 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 LUZP4Q9P127 313 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 HESX1Q9UBX0 185 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A10Q9ULF5 831 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
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PTPRC-212ENST00000491302 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 SLC29A2Q14542 456 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP52Q8N1V2 620 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 MUL1Q969V5 352 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP10Q9Y6W6 482 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS20P59510 1910 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 CYP27B1O15528 508 aa9.14□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 FGAP02671 866 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 SLFN5Q08AF3 891 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 IQCB1Q15051 598 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 INSCQ1MX18 579 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 MID2Q9UJV3 735 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 CDYLQ9Y232 598 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 DIRC3C9JPN6 131 aa9.13□□□□□ -0.95
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