RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 TTC26A0AVF1 554 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 SOAT2O75908 522 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 CCDC192P0DO97 292 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 TYMPP19971 482 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 WEE1P30291 646 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 RAP1GAPP47736 663 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 ST3GAL1Q11201 340 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 NBR1Q14596 966 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 STPG1Q5TH74 334 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 KBTBD6Q86V97 674 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 TASP1Q9H6P5 420 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.63■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 ATG13O75143 517 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 PRAMEF12O95522 483 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 PLS3P13797 630 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 GUCY2CP25092 1073 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 PP2D1A8MPX8 630 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 ATRXP46100 2492 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 MCM2P49736 904 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 VEPH1Q14D04 833 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 GCNAQ96QF7 691 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 CDC25AP30304 524 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 CDC25CP30307 473 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 GUCY2FP51841 1108 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 CYP4F8P98187 520 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 KCNK18Q7Z418 384 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 BICD1Q96G01 975 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 GKN1Q9NS71 199 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 MYH11P35749 1972 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 LACTBL1A8MY62 500 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 AKAP3O75969 853 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 ODC1P11926 461 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 TNFSF9P41273 254 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 LILRA4P59901 499 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 KYAT1Q16773 422 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 SENP8Q96LD8 212 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 VPS45Q9NRW7 570 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 KCNK5O95279 499 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 PAX3P23760 479 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 MPLP40238 635 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 TAF12Q16514 161 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 IL21Q9HBE4 155 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-210ENST00000491139 FRYQ5TBA9 3013 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 H0YCG3 227 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 LAD1O00515 517 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 PPEF2O14830 753 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 RUNX3Q13761 415 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 SPATA1Q5VX52 437 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 RNF43Q68DV7 783 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 ATF6P18850 670 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 LIG4P49917 911 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 AMPD2Q01433 879 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 IL17AQ16552 155 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 PLK5Q496M5 336 aa22.56■■□□□ 1.2
NELFE-210ENST00000491139 EBF3Q9H4W6 596 aa22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms