RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP72	Q9P209	647 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNA1H	O95180	2353 aa		18.63	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	KRBA1	A5PL33	1030 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF233	A6NK53	670 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PROB1	E7EW31	1015 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PPEF2	O14830	753 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	WEE1	P30291	646 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	MRE11	P49959	708 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GUCY2F	P51841	1108 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TWF1	Q12792	350 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CUL4B	Q13620	913 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ITIH5	Q86UX2	942 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR152	Q8TDT2	470 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TIGD1	Q96MW7	591 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	NELL2	Q99435	816 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PHOX2B	Q99453	314 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CORO1B	Q9BR76	489 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	YIPF1	Q9Y548	306 aa		18.62	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	MTMR11	A4FU01	709 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SOBP	A7XYQ1	873 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF20A	O95235	890 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SMC2	O95347	1197 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	VNN2	O95498	520 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CFH	P08603	1231 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEA9	P43362	315 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	RBP5	P82980	135 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CXorf38	Q8TB03	319 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	DNASE1L2	Q92874	299 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMG2	Q969U7	264 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB16	Q96NS5	453 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC3	Q9BY71	257 aa		18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GPC5	P78333	572 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP4	Q13115	394 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	FLCN	Q8NFG4	579 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SMARCD2	Q92925	531 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ACBD6	Q9BR61	282 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	RMND1	Q9NWS8	449 aa		18.6	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	HUS1	O60921	280 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GLUL	P15104	373 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	CEBPB	P17676	345 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXD13	P35453	343 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	LHX1	P48742	406 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR49	Q8IV35	697 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SAAL1	Q96ER3	474 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCB6	Q9NP58	842 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	INTS13	Q9NVM9	706 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	OBP2A	Q9NY56	170 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	NOTCH4	Q99466	2003 aa		18.59	■□□□□ 0.57
HDAC10-216	ENST00000489424	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MOSPD3	O75425	235 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CASP1	P29466	404 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	NBL1	P41271	181 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CCR2	P41597	374 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPY1	Q01534	308 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO1E	Q12965	1108 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	VEPH1	Q14D04	833 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		18.58	■□□□□ 0.56
HDAC10-216	ENST00000489424	WSCD1	Q658N2	575 aa		18.58	■□□□□ 0.56

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