RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487036.1

FAM208A-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member A, human

TSL 3

Gene FAM208A, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208A-208	ENST00000487036	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.01	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.01	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.01	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.01	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.01	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	POLH	Q9Y253	713 aa		4.01	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.01	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.01	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	GOLIM4	O00461	696 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	PEX2	P28328	305 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	SERPINB3	P29508	390 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	TM4SF4	P48230	202 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF81	P51508	661 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	CTXN1	P60606	82 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	SP140	Q13342	867 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	PICALM	Q13492	652 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	AFMID	Q63HM1	303 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	STON2	Q8WXE9	905 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	WASF1	Q92558	559 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	IL17RA	Q96F46	866 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	ARMT1	Q9H993	441 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	F2RL2	O00254	374 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	FRS3	O43559	492 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	CD1A	P06126	327 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	MYL3	P08590	195 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	SBK3	P0C264	359 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	NPR1	P16066	1061 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	PRDX5	P30044	214 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	PTPN7	P35236	360 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	FLT3LG	P49771	235 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	GZMK	P49863	264 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	CACNB3	P54284	484 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	BIRC2	Q13490	618 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF425	Q6IV72	752 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	IL31RA	Q8NI17	732 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM167A	Q96KS9	214 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	NEU1	Q99519	415 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	MYOC	Q99972	504 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	DUSP26	Q9BV47	211 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	TMEM140	Q9NV12	185 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	PNPO	Q9NVS9	261 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	WIPF3	A6NGB9	483 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036		H3BUI4	141 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	MYO1F	O00160	1098 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	KCNAB3	O43448	404 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	PROP1	O75360	226 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	ARIH2	O95376	493 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	IL2RB	P14784	551 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC6A4	P31645	630 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	HTR3A	P46098	478 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	GPSM2	P81274	684 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	APBA1	Q02410	837 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	REST	Q13127	1097 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	FGL2	Q14314	439 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	BRD3	Q15059	726 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	LONRF1	Q17RB8	773 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	CCDC157	Q569K6	752 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	DACT2	Q5SW24	774 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	ANKS6	Q68DC2	871 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	GPR149	Q86SP6	731 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM208A-208	ENST00000487036	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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