RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 HDAC7Q8WUI4 952 aa35.28■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 TAF4BQ92750 862 aa35.28■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 TMEM209Q96SK2 561 aa35.28■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 MMS19Q96T76 1030 aa35.28■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 CD207Q9UJ71 328 aa35.28■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 POLIQ9UNA4 740 aa35.28■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 ABLIM3O94929 683 aa35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 OR4Q2P0C623 313 aa35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 ZNF667Q5HYK9 610 aa35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 OSTM1Q86WC4 334 aa35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 THEM5Q8N1Q8 247 aa35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 PI4K2AQ9BTU6 479 aa35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 THAP9Q9H5L6 903 aa35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 DPP7Q9UHL4 492 aa35.27■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 GABRDO14764 452 aa35.26■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 CPB1P15086 417 aa35.26■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 SMRP1Q8NCR6 262 aa35.26■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 FBXL13Q8NEE6 735 aa35.26■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 SEMA4DQ92854 862 aa35.26■■■■□ 3.24
CHKB-210ENST00000484266 LRRN2O75325 713 aa35.25■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 CLSTN1O94985 981 aa35.25■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 SPOPLQ6IQ16 392 aa35.25■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP35.25■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 DNAJC25Q9H1X3 360 aa35.25■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 S1PR5Q9H228 398 aa35.25■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 SFXN1Q9H9B4 322 aa35.25■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 COQ4Q9Y3A0 265 aa35.25■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 FMO5P49326 533 aa35.24■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 NFKBIBQ15653 356 aa35.24■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 AAK1Q2M2I8 961 aa35.24■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 TPGS2Q68CL5 300 aa35.24■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa35.24■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 APOL5Q9BWW9 433 aa35.24■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 IMPG2Q9BZV3 1241 aa35.24■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa35.24■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP35.24■■■■□ 3.233e-12■■■■■ 64.6
CHKB-210ENST00000484266 UNC80Q8N2C7 3258 aa35.24■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 TACC1O75410 805 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ATF2P15336 505 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 WARSP23381 471 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 LHX1P48742 406 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 NOP14P78316 857 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 SMYD3Q9H7B4 428 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 RAB20Q9NX57 234 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 SPDYE4A6NLX3 237 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 HCRTO43612 131 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 KCNQ1P51787 676 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 MYL7Q01449 175 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 GPR17Q13304 367 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa35.23■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 C2orf16Q68DN1 1984 aa35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 PMM2O15305 246 aa35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 RFPL2O75678 378 aa35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 FAM163BP0C2L3 166 aa35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 KCNH2Q12809 1159 aa35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 LIN9Q5TKA1 542 aa35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 CREBRFQ8IUR6 639 aa35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 FEZF2Q8TBJ5 459 aa35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ACBD6Q9BR61 282 aa35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 FUCA2Q9BTY2 467 aa35.22■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 SYCE3A1L190 88 aa35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 MBTPS2O43462 519 aa35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ZMYND10O75800 440 aa35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 VNN2O95498 520 aa35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 C8AP07357 584 aa35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 P4HA1P13674 534 aa35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 LRRTM3Q86VH5 581 aa35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 FAM114A1Q8IWE2 563 aa35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ASB2Q96Q27 587 aa35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 SDCBP2Q9H190 292 aa35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 NME7Q9Y5B8 376 aa35.21■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 GRXCR2A6NFK2 248 aa35.2■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 LMO2P25791 158 aa35.2■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ASPAP45381 313 aa35.2■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 ADCY1Q08828 1119 aa35.2■■■■□ 3.23
CHKB-210ENST00000484266 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa35.2■■■■□ 3.23
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