RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 TSC2P49815 1807 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 CLSTN1O94985 981 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 PRCPP42785 496 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 ALDH1A3P47895 512 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 LHX1P48742 406 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPY1Q01534 308 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 TWF1Q12792 350 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 SMARCB1Q12824 385 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 DUSP4Q13115 394 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 PLD1Q13393 1074 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 STIM1Q13586 685 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 PTPN21Q16825 1174 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA20Q8TB22 786 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 SPATA18Q8TC71 538 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 TMC2Q8TDI7 906 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF516Q92618 1163 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 EDAQ92838 391 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 MMS19Q96T76 1030 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 TSG101Q99816 390 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 L1RE1Q9UN81 338 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-209ENST00000484097 MTMR11A4FU01 709 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 MAPK13O15264 365 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT13P13646 458 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 ZXDAP98168 799 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 CENPPQ6IPU0 288 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 MYADMQ96S97 322 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 CORO1BQ9BR76 489 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 CETN3O15182 167 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR37L1O60883 481 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 ASGR2P07307 311 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 RHOP08100 348 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 ATICP31939 592 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 VAMP7P51809 220 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 EPHB3P54753 998 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 TNNC1P63316 161 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 ISM2Q6H9L7 571 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 ACBD6Q9BR61 282 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 YIPF1Q9Y548 306 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 DOCK8Q8NF50 2099 aa20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF197O14709 1029 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 LAMP2P13473 410 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 PCSK1P29120 753 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP1R2P41236 205 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 MYL6P60660 151 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 CLDN10P78369 228 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 MTMR3Q13615 1198 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 CDH7Q9ULB5 785 aa20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 NOTCH4Q99466 2003 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 IKBKBO14920 756 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 AKAP3O75969 853 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 VNN2O95498 520 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 DLG4P78352 724 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-209ENST00000484097 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms