RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 MRIQ9BWK5 157 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 OLFML3Q9NRN5 406 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PDP2Q9P2J9 529 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V1G1O75348 118 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 VIL1P09327 827 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ARFIP2P53365 341 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 YARSP54577 528 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SLC1A5Q15758 541 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SLC15A2Q16348 729 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 XKR9Q5GH70 373 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DAW1Q8N136 415 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ZFAND2BQ8WV99 257 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CLPTM1LQ96KA5 538 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MXRA8Q9BRK3 442 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 STK32BQ9NY57 414 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FOCADQ5VW36 1801 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 LYNP07948 512 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 KRT4P19013 534 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RTP1P59025 263 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 BTKQ06187 659 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MTMR1Q13613 665 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf146Q5VVC0 180 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CYFIP1Q7L576 1253 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RASSF3Q86WH2 238 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RFWD2Q8NHY2 731 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MIPEPQ99797 713 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SYNCQ9H7C4 482 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 GJA3Q9Y6H8 435 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PPM1 405 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PIK3CDO00329 1044 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ITIH2P19823 946 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEA4P43358 317 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 NOP14P78316 857 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CETN1Q12798 172 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 UGCGQ16739 394 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF19Q8IW93 802 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 NIM1KQ8IY84 436 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 BICD1Q96G01 975 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 AAASQ9NRG9 546 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ANAPC7Q9UJX3 599 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF148Q9UQR1 794 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF711Q9Y462 761 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 LTBP1Q14766 1721 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 WNT10BO00744 389 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PGM3O95394 542 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 KRT5P13647 590 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 AMPD1P23109 780 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ADRA1DP25100 572 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 BFSP1Q12934 665 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CLNKQ7Z7G1 428 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RILPQ96NA2 401 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM109Q9BVC6 243 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM55Q9BYV6 548 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 NDE1Q9NXR1 346 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa17.09■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PPP3CAQ08209 521 aa17.08■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 P3H1Q32P28 736 aa17.08■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 BTBD10Q9BSF8 475 aa17.08■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 STARD13Q9Y3M8 1113 aa17.08■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 BRWD3Q6RI45 1802 aa17.08■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CYP26A1O43174 497 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 RRM1P23921 792 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 RPS6P62753 249 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SAMD7Q7Z3H4 446 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB132Q7Z7B7 95 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TTC7BQ86TV6 843 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA24Q86W54 205 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC6Q86X45 466 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ZBED8Q8IZ13 594 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 NSL1Q96IY1 281 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 WNK4Q96J92 1243 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MPP4Q96JB8 637 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 FIZ1Q96SL8 496 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 CNTNAP1P78357 1384 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 ABLIM1O14639 778 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 MAPK4P31152 587 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 EPHB1P54762 984 aa17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CCSAP-204ENST00000483092 APEX2Q9UBZ4 518 aa17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms