RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 GAD1Q99259 594 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 SHANK3Q9BYB0 1731 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 I3L4J1 428 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 TREHO43280 583 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT14P02533 472 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 NDST1P52848 882 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 DCAF6Q58WW2 860 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 HGSNATQ68CP4 663 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 FEZF2Q8TBJ5 459 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 OSBPL8Q9BZF1 889 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 SMYD3Q9H7B4 428 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 FBXL5Q9UKA1 691 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNH4Q9UQ05 1017 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 C2CD2LO14523 706 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 HSPA6P17066 643 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 PTENP60484 403 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT17Q04695 432 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 LPPQ93052 612 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC4A1P02730 911 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 CPB1P15086 417 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 MARCKSL1P49006 195 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 DEFB115Q30KQ5 88 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 ZACNQ401N2 412 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 DUSP28Q4G0W2 176 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC38Q502W7 563 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 EMBQ6PCB8 327 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC9A9Q8IVB4 645 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC13Q8IYE1 715 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 P3H4Q92791 437 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 TNIP3Q96KP6 325 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM7Q9C029 511 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 SAYSD1Q9NPB0 183 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM17Q9Y577 477 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 PAPPAQ13219 1627 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 ACO1P21399 889 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 COBLL1Q53SF7 1204 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM192Q8IY95 271 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 C12orf29Q8N999 325 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAAF3Q8N9W5 541 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM71BQ8TC56 605 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 C9orf72Q96LT7 481 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A0B4J269 797 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC15A5A6NIM6 579 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 GPR25O00155 361 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 CST8O60676 142 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 TADA2AO75478 443 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 GLI1P08151 1106 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 SRGAP2BP0DMP2 458 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 TAF6P49848 677 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 VSIG1Q86XK7 387 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 ABRAQ8N0Z2 381 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 TTYH3Q9C0H2 523 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 MED4Q9NPJ6 270 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 MYH6P13533 1939 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 RASSF10A6NK89 507 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 KBTBD13C9JR72 458 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 TSPY1Q01534 308 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 GLB1LQ6UWU2 654 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 CRYGNQ8WXF5 182 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 RPTORQ8N122 1335 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 CYB561D2O14569 222 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 HMBSP08397 361 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 MYBL1P10243 752 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 GRIK1P39086 918 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 ARSEP51690 589 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 CDC42EP1Q00587 391 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 CRHR2Q13324 411 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC27A1Q6PCB7 646 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 KDELC2Q7Z4H8 507 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 THEM5Q8N1Q8 247 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRVP-201ENST00000482597 NPLOC4Q8TAT6 608 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms