RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 SENP1Q9P0U3 644 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 DSEQ9UL01 958 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 SATB2Q9UPW6 733 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 C10orf71Q711Q0 1435 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 SOBPA7XYQ1 873 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 A8MUI8 341 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 C2CD2LO14523 706 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 RASGRF2O14827 1237 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 SIAH2O43255 324 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 TIMM44O43615 452 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 XYLBO75191 536 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 PDE5AO76074 875 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 DEXIO95424 95 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 ESRRBO95718 433 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 IGKV5-2P06315 115 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 CELA3AP09093 270 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 MSL3P1P0C860 447 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 CDK4P11802 303 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 EPB42P16452 691 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 MUTP22033 750 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 CCNE1P24864 410 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 CDC25AP30304 524 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 FLT3P36888 993 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 NUP107P57740 925 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 PTENP60484 403 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 AP2B1P63010 937 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 TUBA1BP68363 451 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 IL9RQ01113 521 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 CDR2Q01850 454 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 MED21Q13503 144 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 KIF22Q14807 665 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 PTPN21Q16825 1174 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 INF2Q27J81 1249 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 PARP10Q53GL7 1025 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 TUBA1AQ71U36 451 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 SPATC1Q76KD6 591 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 DAAM2Q86T65 1068 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 NIM1KQ8IY84 436 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 LPIN2Q92539 896 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 SKA1Q96BD8 255 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 MPP4Q96JB8 637 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 ECSITQ9BQ95 431 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 ERP44Q9BS26 406 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 Q9H521 79 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GUL6 1792 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 H3BNX3 289 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 GRM8O00222 908 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 AREL1O15033 823 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PKP4-211ENST00000481115 SH3BP5O60239 455 aa7.55□□□□□ -1.2
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