RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 MTRRQ9UBK8 725 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.36■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 HIDE1A8MVS5 230 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 AP5Z1O43299 807 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 KLK7P49862 253 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 CDH8P55286 799 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 GCNT1Q02742 428 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 INCA1Q0VD86 236 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 CUL2Q13617 745 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 SYCP1Q15431 976 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1841Q6NSI8 718 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PDXDC1Q6P996 788 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 SARM1Q6SZW1 724 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 KAT5Q92993 513 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 FAM161BQ96MY7 647 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 IFNKQ9P0W0 207 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.35■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 C2CD2LO14523 706 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ADAM12O43184 909 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 HCRTO43612 131 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 CSPG5O95196 566 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 CXCL14O95715 111 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 WEE2P0C1S8 567 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PBX1P40424 430 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 UBASH3AP57075 661 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PSMD5Q16401 504 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PTPROQ16827 1216 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ZNF280DQ6N043 979 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 GJB7Q6PEY0 223 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 FNIP2Q9P278 1114 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.34■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PQC6 194 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 EPHB6O15197 1021 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 TEX28O15482 410 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 NOL4O94818 638 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 CLSTN1O94985 981 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 METTL23Q86XA0 190 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 GUCD1Q96NT3 240 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PKMYT1Q99640 499 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 GANQ9H2C0 597 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.33■■□□□ 1.01
ACTB-210ENST00000477812 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 H7C4K7 107 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 LMO2P25791 158 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 LHX1P48742 406 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 CREMQ03060 361 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 PTPN21Q16825 1174 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 RRAGAQ7L523 313 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 WHAMMQ8TF30 809 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 CISHQ9NSE2 258 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.32■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 OR6C75A6NL08 312 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 CILPO75339 1184 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 IQCEQ6IPM2 695 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 JAKMIP2Q96AA8 810 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 TWNKQ96RR1 684 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 TMEM209Q96SK2 561 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 ACBD6Q9BR61 282 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-210ENST00000477812 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.31■■□□□ 1
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