RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475208.5

TMEM54-205, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM54, Length 768 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-205ENST00000475208 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 DPYSL4O14531 572 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 FGF19O95750 216 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 PAX3P23760 479 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 MCM6Q14566 821 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 TMEM132DQ14C87 1099 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 ITIH5Q86UX2 942 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 SPEM1Q8N4L4 309 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 LRRC3BQ96PB8 259 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 HSFX1Q9UBD0 423 aa26.98■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 PIRO00625 290 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 PLCG1P19174 1290 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 SLC39A12Q504Y0 691 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 LAIR1Q6GTX8 287 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 TXNDC11Q6PKC3 985 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 PRR23BQ6ZRT6 265 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 TTC8Q8TAM2 541 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 RAD54LQ92698 747 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 ZFYVE19Q96K21 471 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 FIZ1Q96SL8 496 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 LPIN3Q9BQK8 851 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 DERAQ9Y315 318 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 ANK1P16157 1881 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 ANO9A1A5B4 782 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 MYBPHLA2RUH7 354 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 CYP11A1P05108 521 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 NMT1P30419 496 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 CTHP32929 405 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 ACOT2P49753 483 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 GTF2BQ00403 316 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 MGAT5BQ3V5L5 792 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 WDR44Q5JSH3 913 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 Q6ZS52 159 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 OBP2AQ9NY56 170 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 GTSE1Q9NYZ3 720 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM54-205ENST00000475208 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 ANKRD63C9JTQ0 380 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 PRAMEF12O95522 483 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 FNTBP49356 437 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 CDR1P51861 262 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 CYP4F8P98187 520 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 GRIN1Q05586 938 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 DMWDQ09019 674 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SPEM2Q0P670 501 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 VEPH1Q14D04 833 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 DSEQ9UL01 958 aa26.95■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 TISP43B9A030 160 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 ATF6P18850 670 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 ABCD1P33897 745 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 TUFMP49411 452 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 DGKKQ5KSL6 1271 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 ADALQ6DHV7 355 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 GCNAQ96QF7 691 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 ASB7Q9H672 318 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 TASP1Q9H6P5 420 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 C2CD2Q9Y426 696 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 RETP07949 1114 aa26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 PON2Q15165 354 aa26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 METTL23Q86XA0 190 aa26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 BPIFB1Q8TDL5 484 aa26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 RTKNQ9BST9 563 aa26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 IL21Q9HBE4 155 aa26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.93■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SCN1AP35498 2009 aa26.92■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 K7ESF4 209 aa26.92■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 CYB561D2O14569 222 aa26.92■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 BMP15O95972 392 aa26.92■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 CDC25CP30307 473 aa26.92■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 TAF6P49848 677 aa26.92■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 TNK2Q07912 1038 aa26.92■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 DPP3Q9NY33 737 aa26.92■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SPTBN2O15020 2390 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 HRO43593 1189 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 WEE1P30291 646 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 PLCB2Q00722 1185 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 TAF12Q16514 161 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 SLFN12LQ6IEE8 588 aa26.91■■□□□ 1.9
TMEM54-205ENST00000475208 LONP2Q86WA8 852 aa26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms