RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 NPNTQ6UXI9 565 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 C14orf80Q86SX3 495 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 SSH3Q8TE77 659 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 CAVIN3Q969G5 261 aa8.61□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 A0A087X1B8 175 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 GCP02774 474 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 HKR1P10072 659 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 DYRK1AQ13627 763 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 LLGL1Q15334 1064 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 GPR150Q8NGU9 434 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.6□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 CHEK2O96017 543 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 KCNJ5P48544 419 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 FOXI1Q12951 378 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 PCSK4Q6UW60 755 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 POC1BQ8TC44 478 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.59□□□□□ -1.03
SGCE-210ENST00000472326 A6NNZ2 444 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 VSTM5A8MXK1 200 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 DNAJB5O75953 348 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 UNC5CO95185 931 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 PROZP22891 400 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 PLA2G5P39877 138 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 AVPR1BP47901 424 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 SEC24CP53992 1094 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 ANO6Q4KMQ2 910 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 EMC10Q5UCC4 262 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 SNX19Q92543 992 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 INTS13Q9NVM9 706 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.58□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 KITP10721 976 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TGM1P22735 817 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TAP1Q03518 808 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 SWSAP1Q6NVH7 229 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TTC8Q8TAM2 541 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 AGAP2Q99490 1192 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 SIK2Q9H0K1 926 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.57□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 A0A1W2PPL8 197 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 ERC2O15083 957 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 NPR1P16066 1061 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 NPTX2P47972 431 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 Q6ZNX1 250 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 LPIN2Q92539 896 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 COQ10AQ96MF6 247 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.56□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 ATF3P18847 181 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 MPLP40238 635 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 BLOC1S1P78537 153 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TCF15Q12870 199 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 MPP3Q13368 585 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 GRM3Q14832 879 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 LNX2Q8N448 690 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 TOR3AQ9H497 397 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 RAD54BQ9Y620 910 aa8.55□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 MAST3O60307 1309 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 CAPN8A6NHC0 703 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 E7ENX8 843 aa8.54□□□□□ -1.04
SGCE-210ENST00000472326 F5H697 171 aa8.54□□□□□ -1.04
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