RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.39■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 MYADMQ96S97 322 aa21.39■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.39■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.39■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 DOCK8Q8NF50 2099 aa21.39■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 MTMR11A4FU01 709 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 VNN2O95498 520 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 PRCPP42785 496 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 AP3M2P53677 418 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 UBE2HP62256 183 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 CLDN10P78369 228 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 TWF1Q12792 350 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 DUSP4Q13115 394 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 CENPPQ6IPU0 288 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 SPATA18Q8TC71 538 aa21.38■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 MAPK13O15264 365 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ASGR2P07307 311 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 PTPN2P17706 415 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 TRPC3Q13507 836 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 DPH6Q7L8W6 267 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ELMOD1Q8N336 334 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 TMC2Q8TDI7 906 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 EDAQ92838 391 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 YIPF1Q9Y548 306 aa21.37■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 NOTCH4Q99466 2003 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 PHACTR2O75167 634 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 AKAP3O75969 853 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 RHOP08100 348 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 LHX1P48742 406 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 DLG4P78352 724 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ZXDAP98168 799 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 MYL7Q01449 175 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 TSPY1Q01534 308 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 SMARCB1Q12824 385 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 PLD1Q13393 1074 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ADAM9Q13443 819 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 BIRC3Q13489 604 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM31Q5JXX7 168 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 IQCEQ6IPM2 695 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ACBD6Q9BR61 282 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 C11orf16Q9NQ32 467 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 GPR37L1O60883 481 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 LAMP2P13473 410 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ALDH1A3P47895 512 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 MTMR3Q13615 1198 aa21.35■■□□□ 1.01
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CTPS1-206ENST00000470271 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 LRRTM3Q86VH5 581 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ITFG1Q8TB96 612 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 MMS19Q96T76 1030 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 CORO1BQ9BR76 489 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 CEP72Q9P209 647 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 CDH7Q9ULB5 785 aa21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 GABRDO14764 452 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 IKBKBO14920 756 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ATICP31939 592 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 VAMP7P51809 220 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 EPHB3P54753 998 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 MYL6P60660 151 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 TNNC1P63316 161 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 NCOA4Q13772 614 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 OSTM1Q86WC4 334 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 ADSSL1Q8N142 457 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 FGF13Q92913 245 aa21.34■■□□□ 1.01
CTPS1-206ENST00000470271 TSG101Q99816 390 aa21.34■■□□□ 1.01
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