RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 TAP1Q03518 808 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 SLC10A6Q3KNW5 377 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF410Q86VK4 478 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 SH2D3CQ8N5H7 860 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 FBXO25Q8TCJ0 367 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF236Q9UL36 1845 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 O00370 1275 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 PAEPP09466 180 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF844Q08AG5 666 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM132DQ14C87 1099 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 PPP1R7Q15435 360 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 DCUN1D2Q6PH85 259 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 WDTC1Q8N5D0 677 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 EXD1Q8NHP7 514 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 MCEEQ96PE7 176 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 TMBIM4Q9HC24 238 aa18.2■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 RALAP11233 206 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ZSCAN26Q16670 478 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 DENND1BQ6P3S1 775 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 OR2W6PQ8NHA6 318 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 FAM129AQ9BZQ8 928 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 STRIP2Q9ULQ0 834 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 KAT6AQ92794 2004 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 A0A1B0GUA9 196 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 RPS6KA5O75582 802 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 P4HA1P13674 534 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 GJC1P36383 396 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 RAD23BP54727 409 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CDH8P55286 799 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 SKOR1P84550 965 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 SNX1Q13596 522 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 RUFY4Q6ZNE9 571 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CXorf38Q8TB03 319 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ACAP3Q96P50 834 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 HERPUD2Q9BSE4 406 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CAPS2Q9BXY5 557 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 SDCBP2Q9H190 292 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 LHX5Q9H2C1 402 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 SMYD3Q9H7B4 428 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 VRTNQ9H8Y1 702 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 HOMER3Q9NSC5 361 aa18.19■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CETN2P41208 172 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ILDR2Q71H61 639 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 C3orf20Q8ND61 904 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 GRK7Q8WTQ7 553 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 DCLK3Q9C098 648 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CYP3A43Q9HB55 503 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CHST7Q9NS84 486 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 C2CD2Q9Y426 696 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ADCY6O43306 1168 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 PMS2P54278 862 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 KRT17Q04695 432 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CYP4A22Q5TCH4 519 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM130Q8N3G9 435 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ATG4AQ8WYN0 398 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 HPDLQ96IR7 371 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 HEMGNQ9BXL5 484 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 OSBPL8Q9BZF1 889 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CENPHQ9H3R5 247 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 SETD4Q9NVD3 440 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ITGA11Q9UKX5 1188 aa18.18■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa18.17■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CALCOCO2Q13137 446 aa18.17■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 KDM7AQ6ZMT4 941 aa18.17■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 NT5DC4Q86YG4 428 aa18.17■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 ART4Q93070 314 aa18.17■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 AGAP1Q9UPQ3 857 aa18.17■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 A6NNZ2 444 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CILPO75339 1184 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 GAS8O95995 478 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 NR1D1P20393 614 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 KIZQ2M2Z5 673 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 TUBB8Q3ZCM7 444 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 LRRC38Q5VT99 294 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 RCOR2Q8IZ40 523 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 SLC4A11Q8NBS3 891 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 DPP3Q9NY33 737 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 CPA4Q9UI42 421 aa18.16■□□□□ 0.5
FAAP20-211ENST00000469733 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms