RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMARCB1Q12824 385 aa20.3■□□□□ 0.84
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TRAPPC10-208ENST00000469521 FSIP1Q8NA03 581 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC10-208ENST00000469521 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.3■□□□□ 0.84
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TRAPPC10-208ENST00000469521 MYO1EQ12965 1108 aa20.28■□□□□ 0.84
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TRAPPC10-208ENST00000469521 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.27■□□□□ 0.84
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.27■□□□□ 0.84
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TRAPPC10-208ENST00000469521 CLCN5P51795 746 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 DPYDQ12882 1025 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 RDH13Q8NBN7 331 aa20.26■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 HPDLQ96IR7 371 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 KXD1Q9BQD3 176 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.26■□□□□ 0.83
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TRAPPC10-208ENST00000469521 RHOBTB3O94955 611 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYL4P12829 197 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNNI1P19237 187 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYL7Q01449 175 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 IER5LQ5T953 404 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM105Q8N8V8 129 aa20.25■□□□□ 0.83
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