RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	RSPH3	Q86UC2	560 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	MIER2	Q8N344	545 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	CPA6	Q8N4T0	437 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	KAT5	Q92993	513 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	HOOK2	Q96ED9	719 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	NFAT5	O94916	1531 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	USP6	P35125	1406 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	TEX33	O43247	280 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	POMC	P01189	267 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	CHN2	P52757	468 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	CDC42EP1	Q00587	391 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM240	Q5SV17	173 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF529	Q6P280	563 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF276	Q8N554	614 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	TMX3	Q96JJ7	454 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	USP54	Q70EL1	1684 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	RPS6KA4	O75676	772 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	IL33	O95760	270 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	PEX11B	O96011	259 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	METRNL	Q641Q3	311 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	MED25	Q71SY5	747 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	DRC7	Q8IY82	874 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	C5	P01031	1676 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF185	O15231	689 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	SGTA	O43765	313 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF202	O95125	648 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	NR4A1	P22736	598 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	CTXN1	P60606	82 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	FAM189B	P81408	668 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	MCL1	Q07820	350 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	IFI44	Q8TCB0	444 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	NEU1	Q99519	415 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	TEX101	Q9BY14	249 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM17-208	ENST00000467080	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	EXOC5	O00471	708 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	FZD7	O75084	574 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	FSHB	P01225	129 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	SLC6A2	P23975	617 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	CREM	Q03060	361 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	SMIM5	Q71RC9	77 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	NSD2	O96028	1365 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	DIRC3	C9JPN6	131 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	ITGB1	P05556	798 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	PDC	P20941	246 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	DSC2	Q02487	901 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RBM17-208	ENST00000467080	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		6.94	□□□□□ -1.3

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