RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456317.1

TTPAL-204, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 2

Gene TTPAL, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-204ENST00000456317 MGAQ8IWI9 3026 aa8.64□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 AP5Z1O43299 807 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 PRKCBP05771 671 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 ATF2P15336 505 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 AXLP30530 894 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 MCM2P49736 904 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 GALK1P51570 392 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 ROR1Q01973 937 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 TRDNQ13061 729 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 RUNX3Q13761 415 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 CCDC51Q96ER9 411 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 CPB2Q96IY4 423 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 CSRNP2Q9H175 543 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 CAPN10Q9HC96 672 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 DISC1Q9NRI5 854 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 OBP2AQ9NY56 170 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 NOTCH2Q04721 2471 aa8.63□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 TRAPPC3O43617 180 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 CHMP2AO43633 222 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 MX1P20591 662 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 FGFR3P22607 806 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.033e-10■■■■■ 44.2
TTPAL-204ENST00000456317 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 P2RY2P41231 377 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 ZNF787Q6DD87 383 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 RASSF3Q86WH2 238 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 PGBD3Q8N328 593 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 DEFB119Q8N690 84 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 WHAMMQ8TF30 809 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 FNBP1Q96RU3 617 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 CDC6Q99741 560 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 EBF3Q9H4W6 596 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 GKN1Q9NS71 199 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 CEP72Q9P209 647 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.62□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 RELNP78509 3460 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 FAM86B1E9PN63 330 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 ABLIM3O94929 683 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 SEC24AO95486 1093 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 NPTXRO95502 500 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 THP07101 528 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 SMARCA1P28370 1054 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 GNAQP50148 359 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 SEC13P55735 322 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 SERINC3Q13530 473 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 UGCGQ16739 394 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 XKR3Q5GH77 459 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 GPR158Q5T848 1215 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 BROXQ5VW32 411 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 CHFRQ96EP1 664 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 MED8Q96G25 268 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 SEPT3Q9UH03 358 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 KNTC1P50748 2209 aa8.61□□□□□ -1.03
TTPAL-204ENST00000456317 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms