RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452779.2

CSAG1-204, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-204ENST00000452779 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.91□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 CDH22Q9UJ99 828 aa14.91□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.91□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 MYO10Q9HD67 2058 aa14.91□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 A0A0C4DFX4 3053 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 CCL16O15467 120 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 STX10O60499 249 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 LHX1P48742 406 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 TSPY1Q01534 308 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 ENPEPQ07075 957 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 SMARCB1Q12824 385 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 ELMOD1Q8N336 334 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.9□□□□□ -0.02
CSAG1-204ENST00000452779 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 OR4Q2P0C623 313 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 PCSK1P29120 753 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 MYL6P60660 151 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 DLG4P78352 724 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 PLD1Q13393 1074 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 NCOA4Q13772 614 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 NELFBQ8WX92 580 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 ACBD6Q9BR61 282 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 SNX25Q9H3E2 840 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 L1RE1Q9UN81 338 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 USTQ9Y2C2 406 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 CLUHO75153 1309 aa14.89□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 PAPLNO95428 1278 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 SEC24AO95486 1093 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 POU2F2P09086 479 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 FAM163BP0C2L3 166 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 P4HA1P13674 534 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 ALDH1A3P47895 512 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 DUSP4Q13115 394 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF699Q32M78 642 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 ZACNQ401N2 412 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 IQCEQ6IPM2 695 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 SV2AQ7L0J3 742 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 TAF4BQ92750 862 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 MTMR11A4FU01 709 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 TRIM49P0CI25 452 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 TRIM49CP0CI26 452 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 PTPN2P17706 415 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 BMP6P22004 513 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 FSHRP23945 695 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 GTF2H1P32780 548 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 PIK3CAP42336 1068 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 GCLMP48507 274 aa14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CSAG1-204ENST00000452779 EPHB3P54753 998 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms