RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 MS4A14Q96JA4 679 aa22.31■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.31■■□□□ 1.16
GPC1-202ENST00000420138 GHRP10912 638 aa22.31■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.3■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.3■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.29■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 NME7Q9Y5B8 376 aa22.29■■□□□ 1.16
GPC1-202ENST00000420138 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GPC1-202ENST00000420138 KCNK3O14649 394 aa22.29■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 CAGE1Q8TC20 777 aa22.29■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 CBX1P83916 185 aa22.28■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.28■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 TRIP11Q15643 1979 aa22.28■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 CD19P15391 556 aa22.27■■□□□ 1.16
GPC1-202ENST00000420138 PAK2Q13177 524 aa22.27■■□□□ 1.16
GPC1-202ENST00000420138 MESDQ14696 234 aa22.27■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 LHX5Q9H2C1 402 aa22.27■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.27■■□□□ 1.16
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GPC1-202ENST00000420138 BRD3Q15059 726 aa22.27■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.27■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.27■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 PBKQ96KB5 322 aa22.27■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.27■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 MIOSQ9NXC5 875 aa22.27■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 SQORQ9Y6N5 450 aa22.27■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.26■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 O00370 1275 aa22.26■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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