RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
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PTPRJ-201ENST00000418331 NDE1Q9NXR1 346 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.41■■□□□ 1.18
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PTPRJ-201ENST00000418331 GGT7Q9UJ14 662 aa22.4■■□□□ 1.18
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PTPRJ-201ENST00000418331 INPP1P49441 399 aa22.39■■□□□ 1.18
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PTPRJ-201ENST00000418331 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.39■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 IL31Q6EBC2 164 aa22.38■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM120BA0PK00 339 aa22.38■■□□□ 1.17
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