RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 TFAP2BQ92481 460 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 UROC1Q96N76 676 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 ABL1P00519 1130 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 LMO2P25791 158 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 GNA15P30679 374 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 OR1G1P47890 313 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 WSCD1Q658N2 575 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 APPL2Q8NEU8 664 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 COL4A6Q14031 1691 aa24.83■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 RCCD1A6NED2 376 aa24.83■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 HUS1O60921 280 aa24.83■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 AMHP03971 560 aa24.83■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 PBX3P40426 434 aa24.83■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.83■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 NENFQ9UMX5 172 aa24.83■■□□□ 1.57
CNN3-202ENST00000394202 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 FGBP02675 491 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 TNFAIP3P21580 790 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 BRD2P25440 801 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 CDR2Q01850 454 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 TMEM240Q5SV17 173 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 OSTM1Q86WC4 334 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 REXO1L1PQ8IX06 675 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 DPF3Q92784 378 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.565e-16■■■□□ 17.6
CNN3-202ENST00000394202 NAGPAQ9UK23 515 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 TACC1O75410 805 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 BAIAP3O94812 1187 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 CCDC175P0C221 793 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 BPIFB4P59827 614 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.82■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 NRP1O14786 923 aa24.81■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 THAP12O43422 761 aa24.81■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 PDGFRBP09619 1106 aa24.81■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.81■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa24.81■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 PACSIN1Q9BY11 444 aa24.81■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.81■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.81■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ZBBXA8MT70 800 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 EFCAB14O75071 495 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 SLC11A1P49279 550 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 SPA17Q15506 151 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ACOT1Q86TX2 421 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 C12orf29Q8N999 325 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 DPH6Q7L8W6 267 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 VPS36Q86VN1 386 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 LACRTQ9GZZ8 138 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 KCND1Q9NSA2 647 aa24.8■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 A8MXQ7 604 aa24.79■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 CD19P15391 556 aa24.79■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 ANXA13P27216 316 aa24.79■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 PASD1Q8IV76 773 aa24.79■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 LRRC43Q8N309 656 aa24.79■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.79■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.79■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 GABRDO14764 452 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 GALTP07902 379 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 PAEPP09466 180 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 MAGEA1P43355 309 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 KRT83P78385 493 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 CCDC142Q17RM4 750 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 CWH43Q9H720 699 aa24.78■■□□□ 1.56
CNN3-202ENST00000394202 MARCH5Q9NX47 278 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms