RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 NLRP12P59046 1061 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 MYL7Q01449 175 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 ROR1Q01973 937 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 SMARCB1Q12824 385 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 PDCL2Q8N4E4 241 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC150Q8NCX0 1101 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 MMS19Q96T76 1030 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 IMPG2Q9BZV3 1241 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 S1PR5Q9H228 398 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 REV3LO60673 3130 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 PRRG1O14668 218 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ZMYND10O75800 440 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ABLIM3O94929 683 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ATF2P15336 505 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 PCSK1P29120 753 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 GCLMP48507 274 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 STX17P56962 302 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MYL6P60660 151 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPY1Q01534 308 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR17Q13304 367 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF699Q32M78 642 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF667Q5HYK9 610 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT39Q6A163 491 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.231e-5■□□□□ 10.3
PGGT1B-202ENST00000379615 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 EPHX3Q9H6B9 360 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 XYLBO75191 536 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 C8AP07357 584 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM49P0CI25 452 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM49CP0CI26 452 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC192P0DO97 292 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXA9P31269 272 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 PIK3CAP42336 1068 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TMC5Q6UXY8 1006 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR149Q86SP6 731 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ACBD6Q9BR61 282 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 APOL5Q9BWW9 433 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 PRKD2Q9BZL6 878 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 PIDD1Q9HB75 910 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 PRKAG3Q9UGI9 489 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 L1RE1Q9UN81 338 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR27A2RRH5 827 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TACC1O75410 805 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 HLA-DRAP01903 254 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MXI1P50539 228 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP3CAQ08209 521 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ADCY1Q08828 1119 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 CETN1Q12798 172 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 LIMS2Q7Z4I7 341 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SUSD6Q92537 303 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 XYLT2Q9H1B5 865 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 SNX25Q9H3E2 840 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP4F11Q9HBI6 524 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ANO10Q9NW15 660 aa16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MUC3AQ02505 3323 aa16.48■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 GABRDO14764 452 aa16.48■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 VNN1O95497 513 aa16.48■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PGGT1B-202ENST00000379615 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms