RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 LCA5LO95447 670 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 RAD23BP54727 409 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM240Q5SV17 173 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 TAF3Q5VWG9 929 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 WHAMMQ8TF30 809 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 A0A087X0T9 212 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 ZSCAN12O43309 604 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 THAP12O43422 761 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 TRAPPC3O43617 180 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 ALDH2P05091 517 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 FAM228BP0C875 321 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 EPHB4P54760 987 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 SPATA18Q8TC71 538 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 HASPINQ8TF76 798 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 SUSD3Q96L08 255 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 DSEQ9UL01 958 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.16■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 COL4A6Q14031 1691 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 PTPRSQ13332 1948 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 A8MXQ7 604 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 M0QZQ0 153 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 CD19P15391 556 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 TNS4Q8IZW8 715 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 TWNKQ96RR1 684 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.15■□□□□ 0.82
PRRT1-202ENST00000375150 NRP1O14786 923 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 MED7O43513 233 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TADA2AO75478 443 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ITGB1P05556 798 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 MMEP08473 750 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CHRNB2P17787 502 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 BRCC3P46736 316 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 LHX1P48742 406 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 SLC11A1P49279 550 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 FMO1Q01740 532 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CYP27A1Q02318 531 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 WSCD1Q658N2 575 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 METTL23Q86XA0 190 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 HERVK_113Q902F9 699 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 YME1L1Q96TA2 773 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 NAGPAQ9UK23 515 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TSC2P49815 1807 aa20.14■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CARNS1A5YM72 827 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ESPNB1AK53 854 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CALCAP01258 141 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ORC1Q13415 861 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 TNIP3Q96KP6 325 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 KCND1Q9NSA2 647 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 HCSTQ9UBK5 93 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 F8W810 466 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 I3L4J1 428 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 GABRDO14764 452 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF263O14978 683 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 CYP11A1P05108 521 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRT1-202ENST00000375150 GALTP07902 379 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms