RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369592.1

SMNDC1-201, Transcript of survival motor neuron domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene SMNDC1, Length 1,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMNDC1-201ENST00000369592 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 FGF13Q92913 245 aa22.13■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.12■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 PDXKO00764 312 aa22.12■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 PTPN2P17706 415 aa22.12■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 CLDN10P78369 228 aa22.12■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.12■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 RDH13Q8NBN7 331 aa22.12■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.12■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 L1RE1Q9UN81 338 aa22.12■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 POLIQ9UNA4 740 aa22.12■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 MICAL2O94851 1124 aa22.11■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.11■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.11■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.11■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.11■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.11■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 SPATA18Q8TC71 538 aa22.11■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.11■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 PKMYT1Q99640 499 aa22.11■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.11■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 GABRDO14764 452 aa22.1■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 MOSPD3O75425 235 aa22.1■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 CCR2P41597 374 aa22.1■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 TWF1Q12792 350 aa22.1■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 NFIL3Q16649 462 aa22.1■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.1■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.1■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.1■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 OSTM1Q86WC4 334 aa22.09■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 METTL23Q86XA0 190 aa22.09■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.09■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 PRSS33Q8NF86 280 aa22.09■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.09■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.09■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 PARM1Q6UWI2 310 aa22.08■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 DPH6Q7L8W6 267 aa22.08■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.08■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 FGF14Q92915 247 aa22.08■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.08■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 HPDLQ96IR7 371 aa22.08■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 ACBD6Q9BR61 282 aa22.08■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 CORO1BQ9BR76 489 aa22.08■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.08■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 GDE1Q9NZC3 331 aa22.08■■□□□ 1.13
SMNDC1-201ENST00000369592 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.08■■□□□ 1.13
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SMNDC1-201ENST00000369592 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.07■■□□□ 1.12
SMNDC1-201ENST00000369592 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.07■■□□□ 1.12
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SMNDC1-201ENST00000369592 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMNDC1-201ENST00000369592 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.07■■□□□ 1.12
SMNDC1-201ENST00000369592 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SMNDC1-201ENST00000369592 TIGD1Q96MW7 591 aa22.07■■□□□ 1.12
SMNDC1-201ENST00000369592 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.07■■□□□ 1.12
SMNDC1-201ENST00000369592 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.07■■□□□ 1.12
SMNDC1-201ENST00000369592 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.07■■□□□ 1.12
SMNDC1-201ENST00000369592 HUS1O60921 280 aa22.06■■□□□ 1.12
SMNDC1-201ENST00000369592 TNNI1P19237 187 aa22.06■■□□□ 1.12
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