RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TWF1Q12792 350 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 RTL10Q7L3V2 364 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 OTOP3Q7RTS5 596 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 LRRTM3Q86VH5 581 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf16Q9NQ32 467 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 DOCK8Q8NF50 2099 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 NOTCH4Q99466 2003 aa16.05■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM49BA6NDI0 452 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 FAM86C2PA6NEL3 165 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 HUS1O60921 280 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 SOAT2O75908 522 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 BMP6P22004 513 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 FSHRP23945 695 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 MYL6P60660 151 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CLDN10P78369 228 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 MYO1EQ12965 1108 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 DUSP4Q13115 394 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC142Q17RM4 750 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CENPPQ6IPU0 288 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 LIMS2Q7Z4I7 341 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 THEM5Q8N1Q8 247 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ITFG1Q8TB96 612 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 EEF2KMTQ96G04 330 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CEP72Q9P209 647 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 MAPK13O15264 365 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 VNN1O95497 513 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 RHOP08100 348 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM49P0CI25 452 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM49CP0CI26 452 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ALADP13716 330 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ADAM9Q13443 819 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 BIRC3Q13489 604 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PTPN21Q16825 1174 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 SLC5A9Q2M3M2 681 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ADSSL1Q8N142 457 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TMC2Q8TDI7 906 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 XYLT2Q9H1B5 865 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC25Q9H1X3 360 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 MAFFQ9ULX9 164 aa16.03■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 BIN1O00499 593 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 GABRDO14764 452 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 VAMP7P51809 220 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TRPC3Q13507 836 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CAMK4Q16566 473 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 POTEHQ6S545 545 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 HS6ST3Q8IZP7 471 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM86AQ8N2M4 240 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 ING5Q8WYH8 240 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TCEAL4Q96EI5 215 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 PKMYT1Q99640 499 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 CORO1BQ9BR76 489 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 EPS15L1Q9UBC2 864 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 NME7Q9Y5B8 376 aa16.02■□□□□ 0.16
CSAG1-201ENST00000361211 TRIOO75962 3097 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 PHACTR2O75167 634 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 CEBPBP17676 345 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 LMO2P25791 158 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 CCR2P41597 374 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 AP3M2P53677 418 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 ZXDAP98168 799 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 MYL7Q01449 175 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 NCOA4Q13772 614 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 MORC3Q14149 939 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 ZACNQ401N2 412 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD40Q6AI12 368 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms