RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359308.8

XRCC6-201, Transcript of X-ray repair cross complementing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene XRCC6, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6-201ENST00000359308 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 GAS8O95995 478 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 KRT1P04264 644 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ATF2P15336 505 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 AP3M2P53677 418 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 SLMAPQ14BN4 828 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ARMCX2Q7L311 632 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 CPB2Q96IY4 423 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 WHRNQ9P202 907 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 SIX4Q9UIU6 781 aa14.52□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 C22orf31O95567 290 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 FAM107AO95990 144 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 TNNC2P02585 160 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 VTNP04004 478 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 INSRRP14616 1297 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 GRM1Q13255 1194 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 TTLL4Q14679 1199 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 HOMEZQ8IX15 550 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 EXD1Q8NHP7 514 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 SCLT1Q96NL6 688 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 A0A087WZ62 844 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 TRAPPC3O43617 180 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.092e-7■□□□□ 9.9
XRCC6-201ENST00000359308 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ATL2Q8NHH9 583 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 TWNKQ96RR1 684 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 SDCBP2Q9H190 292 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.51□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 HBP1O60381 514 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 CHN1P15882 459 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 OSBPP22059 807 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ARHGAP1Q07960 439 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 TFDP1Q14186 410 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 KYNUQ16719 465 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 PGM2Q96G03 612 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 TMEM51Q9NW97 253 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 GMNCA6NCL1 334 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 RASGRF2O14827 1237 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ITGB3P05106 788 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 LGALS2P05162 132 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 CALB1P05937 261 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 LIG3P49916 1009 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 JADE1Q6IE81 842 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ERICH1Q86X53 443 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 LACTBL1A8MY62 500 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 B4GALT4O60513 344 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ETS1P14921 441 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ITIH2P19823 946 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 CCNG2Q16589 344 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ZNF365Q70YC5 407 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 DPH6Q7L8W6 267 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 AKT3Q9Y243 479 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 PPME1Q9Y570 386 aa14.5□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.49□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 LRRD1A4D1F6 860 aa14.49□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 STAG3L1P0CL83 205 aa14.49□□□□□ -0.09
XRCC6-201ENST00000359308 MAN1A1P33908 653 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms