RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354050.8

PLTP-201, Transcript of phospholipid transfer protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PLTP, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTP-201ENST00000354050 C2orf54Q08AI8 447 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 FAM26DQ5JW98 314 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 ARRDC4Q8NCT1 418 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 WHAMMQ8TF30 809 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 MS4A14Q96JA4 679 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 TWNKQ96RR1 684 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 EHD2Q9NZN4 543 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 ANAPC7Q9UJX3 599 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 ALG6Q9Y672 507 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SCINQ9Y6U3 715 aa16.01■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 A0A1W2PQY0 241 aa16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 CALB1P05937 261 aa16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 CD52P31358 61 aa16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PNPLA4P41247 253 aa16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 ORC1Q13415 861 aa16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SPATA4Q8NEY3 305 aa16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 EPC1Q9H2F5 836 aa16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 STARD7Q9NQZ5 370 aa16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 RNF19AQ9NV58 838 aa16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PADI3Q9ULW8 664 aa16■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 KBTBD13C9JR72 458 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 CEP104O60308 925 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 RHOXF2BP0C7M4 288 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 VDRP11473 427 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 MMP8P22894 467 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 RAB27AP51159 221 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 NDST1P52848 882 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PTP4A2Q12974 167 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 LPIN1Q14693 890 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 BTBD6Q96KE9 485 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 RHOXF2Q9BQY4 288 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 LHX5Q9H2C1 402 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PIRO00625 290 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SPOPO43791 374 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 COMTP21964 271 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 TAF6P49848 677 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SV2CQ496J9 727 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 C2CD6Q53TS8 623 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SGO2Q562F6 1265 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 USP38Q8NB14 1042 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SLC38A7Q9NVC3 462 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PARVAQ9NVD7 372 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 KIAA1257Q9ULG3 409 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SQORQ9Y6N5 450 aa15.99■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PTGESO14684 152 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 ERICH1Q86X53 443 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 ZFP42Q96MM3 310 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PARD6BQ9BYG5 372 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 CARD9Q9H257 536 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 PHF24Q9UPV7 400 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 MICAL2O94851 1124 aa15.97■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 LRPAP1P30533 357 aa15.97■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 MLH1P40692 756 aa15.97■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 DSC3Q14574 896 aa15.97■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 STILQ15468 1287 aa15.97■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 CNGA2Q16280 664 aa15.97■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 LLGL2Q6P1M3 1020 aa15.97■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 RASGEF1CQ8N431 466 aa15.97■□□□□ 0.15
PLTP-201ENST00000354050 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms