RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 SYCE1Q8N0S2 351 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 SAMD15Q9P1V8 674 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 KCNK3O14649 394 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 AOC2O75106 756 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 GZMAP12544 262 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 PHKA2P46019 1235 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 AP3M2P53677 418 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 POU5F1BQ06416 359 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 MAP2K5Q13163 448 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF568Q3ZCX4 644 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 EGFL6Q8IUX8 553 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 WDR49Q8IV35 697 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 OR2W6PQ8NHA6 318 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 TXLNGYQ9BZA5 131 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 IFT122Q9HBG6 1241 aa19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 EVPLQ92817 2033 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 IQCF3P0C7M6 154 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 MMP13P45452 471 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 CCNG1P51959 295 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 PTPROQ16827 1216 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM132AQ24JP5 1023 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 MTHFD1LQ6UB35 978 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 PEX26Q7Z412 305 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 DAAM2Q86T65 1068 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 RAB17Q9H0T7 212 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 COG5Q9UP83 839 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 TNFSF13BQ9Y275 285 aa19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SPNS1-204ENST00000352260 A0A087WZ62 844 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 KLHL33A6NCF5 533 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 ANP32DO95626 131 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 CALCAP01258 141 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 CLTAP09496 248 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 TNFAIP2Q03169 654 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 CUL2Q13617 745 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 NCOA4Q13772 614 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 TCEAL1Q15170 157 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 CLUL1Q15846 466 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 NT5DC3Q86UY8 548 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R16BQ96T49 567 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 PLCD4Q9BRC7 762 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 CDT1Q9H211 546 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 AKT3Q9Y243 479 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 RPSAP08865 295 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 ACO1P21399 889 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 NOP14P78316 857 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 GPC5P78333 572 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 MYO1EQ12965 1108 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 SURF1Q15526 300 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 GRIK4Q16099 956 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 DGKDQ16760 1214 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 FAM187BQ17R55 369 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF20Q3BBV1 942 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 SCARA3Q6AZY7 606 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 RHOT2Q8IXI1 618 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 THNSL1Q8IYQ7 743 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 NUB1Q9Y5A7 615 aa19.76■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 UMODL1Q5DID0 1318 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD33BA6NCL7 494 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 VTNP04004 478 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 SLC10A3P09131 477 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 GCKP35557 465 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 HADHBP55084 474 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 AMHR2Q16671 573 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 ACCSLQ4AC99 568 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 MTMR12Q9C0I1 747 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 NEUROG2Q9H2A3 272 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 FLRT1Q9NZU1 646 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 AMFRQ9UKV5 643 aa19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 CEP104O60308 925 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 HOXC6P09630 235 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 MARCH8Q5T0T0 291 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM109Q9BVC6 243 aa19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP19.74■□□□□ 0.75
SPNS1-204ENST00000352260 CST3P01034 146 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms