RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 PPATQ06203 517 aa16.33■□□□□ 0.2
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PTPRU-201ENST00000345512 SLC26A7Q8TE54 656 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-201ENST00000345512 THTPAQ9BU02 230 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRU-201ENST00000345512 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
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PTPRU-201ENST00000345512 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.33■□□□□ 0.2
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PTPRU-201ENST00000345512 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.31■□□□□ 0.2
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PTPRU-201ENST00000345512 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.31■□□□□ 0.2
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PTPRU-201ENST00000345512 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa16.31■□□□□ 0.2
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PTPRU-201ENST00000345512 SSTR1P30872 391 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRU-201ENST00000345512 NCALDP61601 193 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRU-201ENST00000345512 MMEL1Q495T6 779 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRU-201ENST00000345512 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRU-201ENST00000345512 ABRAQ8N0Z2 381 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRU-201ENST00000345512 ACTL9Q8TC94 416 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRU-201ENST00000345512 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
PTPRU-201ENST00000345512 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.3■□□□□ 0.2
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