RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 UBXN11Q5T124 520 aa19■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 ALKAL1Q6UXT8 129 aa19■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 AMACRQ9UHK6 382 aa19■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa19■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 RECQL4O94761 1208 aa19■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 SEL1L2Q5TEA6 688 aa19■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 SCINQ9Y6U3 715 aa19■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa18.98■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 STAU1O95793 577 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 SLC1A1P43005 524 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 CYP4A22Q5TCH4 519 aa18.98■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 CNTN3Q9P232 1028 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 NFU1Q9UMS0 254 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 RARBP10826 455 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 NDST1P52848 882 aa18.98■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 TTI1O43156 1089 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 ELNP15502 786 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 EPHB4P54760 987 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R40P59535 323 aa18.97■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 LLGL1Q15334 1064 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 FAM228AQ86W67 206 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 BEST2Q8NFU1 509 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 USTQ9Y2C2 406 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 TMEM191CA6NGB0 347 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 NOGQ13253 232 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 FAM47CQ5HY64 1035 aa18.96■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 HPCAL4Q9UM19 191 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 CDY2AQ9Y6F7 541 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa18.96■□□□□ 0.63
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ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS4O75173 837 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 MICAL2O94851 1124 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 FAM153BP0C7A2 387 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 VDRP11473 427 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 SP3Q02447 781 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 FAM153CQ494X1 144 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 PTPN20Q4JDL3 420 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 DPH6Q7L8W6 267 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-201ENST00000331789 PRELID2Q8N945 189 aa18.96■□□□□ 0.63
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