RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 GJB7Q6PEY0 223 aa22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 POF1BQ8WVV4 589 aa22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 ARID3AQ99856 593 aa22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 STK33Q9BYT3 514 aa22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 GANQ9H2C0 597 aa22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 CEP72Q9P209 647 aa22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.61■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 NOL4O94818 638 aa22.6■■□□□ 1.21
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YBX1-201ENST00000321358 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 PCSK1P29120 753 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 CA8P35219 290 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 USP8P40818 1118 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 RAP1GAPP47736 663 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 FIGNQ5HY92 759 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 ZNF280DQ6N043 979 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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YBX1-201ENST00000321358 CHST7Q9NS84 486 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.6■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 A8MXQ7 604 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 C2CD2LO14523 706 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 OAZ2O95190 189 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 EFEMP2O95967 443 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 KRT5P13647 590 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 CREMQ03060 361 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 TMC6Q7Z403 805 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 SPRED2Q7Z698 418 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 UNC93AQ86WB7 457 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 KAT5Q92993 513 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 B3GALT6Q96L58 329 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 ZNF576Q9H609 170 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 TLR9Q9NR96 1032 aa22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.58■■□□□ 1.21
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YBX1-201ENST00000321358 DSG1Q02413 1049 aa22.58■■□□□ 1.21
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YBX1-201ENST00000321358 RTP2Q5QGT7 225 aa22.58■■□□□ 1.21
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YBX1-201ENST00000321358 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.58■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.58■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.58■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 TNIP3Q96KP6 325 aa22.58■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 TCF25Q9BQ70 676 aa22.58■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.58■■□□□ 1.21
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YBX1-201ENST00000321358 SDCBP2Q9H190 292 aa22.58■■□□□ 1.21
YBX1-201ENST00000321358 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.211e-26■■□□□ 11.5
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YBX1-201ENST00000321358 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 EPHB6O15197 1021 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 CXCL14O95715 111 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 PDGFRBP09619 1106 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 CTSAP10619 480 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 CDC25BP30305 580 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 NDST1P52848 882 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 TSPY1Q01534 308 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 TMEM270Q6UE05 265 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 ACBD6Q9BR61 282 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 ZBP1Q9H171 429 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 A0A1W2PQJ5 194 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 OR6C75A6NL08 312 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 GRM6O15303 877 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 CILPO75339 1184 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 STAT1P42224 750 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 PSMD5Q16401 504 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 PTPROQ16827 1216 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 SHC3Q92529 594 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 CDH9Q9ULB4 789 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 MYO6Q9UM54 1294 aa22.57■■□□□ 1.2
YBX1-201ENST00000321358 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.57■■□□□ 1.2
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