RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276833.9

SLC39A4-201, Transcript of solute carrier family 39 member 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC39A4, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4-201ENST00000276833 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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SLC39A4-201ENST00000276833 GRAPQ13588 217 aa20.45■□□□□ 0.86
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SLC39A4-201ENST00000276833 RFX8Q6ZV50 586 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC39A4-201ENST00000276833 NME8Q8N427 588 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC39A4-201ENST00000276833 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SLC39A4-201ENST00000276833 FBXO27Q8NI29 283 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC39A4-201ENST00000276833 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SLC39A4-201ENST00000276833 PAFAH2Q99487 392 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC39A4-201ENST00000276833 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC39A4-201ENST00000276833 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SLC39A4-201ENST00000276833 GALNT8Q9NY28 637 aa20.45■□□□□ 0.86
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