RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262067.4

TSPAN13-201, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN13, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-201ENST00000262067 ERICH1Q86X53 443 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 MYADML2A6NDP7 307 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 MED7O43513 233 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 PHF2O75151 1096 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 DR1Q01658 176 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 SNX27Q96L92 541 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 TRIM51Q9BSJ1 452 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 CEP83Q9Y592 693 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM191CA6NGB0 347 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 AGPSO00116 658 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 DAPK3O43293 454 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 CA12O43570 354 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 LLGL1Q15334 1064 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 SEC14L1Q92503 715 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 C18orf8Q96DM3 657 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM176AQ96HP8 235 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 LHX5Q9H2C1 402 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 O00370 1275 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 STAU1O95793 577 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 SYF2O95926 243 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 RARAP10276 462 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 GGCXP38435 758 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 TAS2R40P59535 323 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 C7orf31Q8N865 590 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 CYTH4Q9UIA0 394 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 USTQ9Y2C2 406 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 DERAQ9Y315 318 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 CHRNA3P32297 505 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 CYP4A22Q5TCH4 519 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 DNAJC24Q6P3W2 148 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 TTC27Q6P3X3 843 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 PLVAPQ9BX97 442 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 NEUROG2Q9H2A3 272 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 MED4Q9NPJ6 270 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 PCNTO95613 3336 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 HOXC8P31273 242 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 YARSP54577 528 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 FAM193AP78312 1265 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 DPH5Q9H2P9 285 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 IP6K2Q9UHH9 426 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 GABRQQ9UN88 632 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TSPAN13-201ENST00000262067 GOLGA6BA6NDN3 693 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 FSCN2O14926 492 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 AXLP30530 894 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 PTGIRP43119 386 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 PSMC4P43686 418 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 TERF2Q15554 542 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 ZBTB6Q15916 424 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 RHOT1Q8IXI2 618 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 FAM71BQ8TC56 605 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 MCEEQ96PE7 176 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 RNF19AQ9NV58 838 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 CITO14578 2027 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 PPEF2O14830 753 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 MAN1A1P33908 653 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 GYS2P54840 703 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 CYP1B1Q16678 543 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 PTPN20Q4JDL3 420 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 APOL6Q9BWW8 343 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 TRIM31Q9BZY9 425 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 PCYOX1Q9UHG3 505 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 FAM187AA6NFU0 413 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 PSTPIP1O43586 416 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 RECQL4O94761 1208 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 GNAT1P11488 350 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 AKAP5P24588 427 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 NDST1P52848 882 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TSPAN13-201ENST00000262067 FCGRTP55899 365 aa25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms