RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 GLRA3O75311 464 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM49P0CI25 452 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM49CP0CI26 452 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 LHX1P48742 406 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.45□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.45□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 E2F6O75461 281 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SYTL3Q4VX76 610 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 IL1RL1Q01638 556 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 CXorf38Q8TB03 319 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 LZICQ8WZA0 190 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 MTFR1LQ9H019 292 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 E7ENQ6 273 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TIMM44O43615 452 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TADA2AO75478 443 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 KRT8P05787 483 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 EXD1Q8NHP7 514 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRB-201ENST00000261266 SYCE1LA8MT33 242 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 HACD1B0YJ81 288 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 CTDNEP1O95476 244 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 MAGEA4P43358 317 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TROAPQ12815 778 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 Q3C1V9 767 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 RAET1EQ8TD07 263 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 AIPL1Q9NZN9 384 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.43□□□□□ -0.9
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