RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 STX17P56962 302 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ZP2Q05996 745 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 UVSSAQ2YD98 709 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CES5AQ6NT32 575 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 TCEAL8Q8IYN2 117 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CRISPLD1Q9H336 500 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 POMKQ9H5K3 350 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 VRTNQ9H8Y1 702 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 FAM50BQ9Y247 325 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 C19orf67A6NJJ6 358 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 HCRTO43612 131 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 HUS1O60921 280 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ATICP31939 592 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 GCLMP48507 274 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 PAK1Q13153 545 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 NCOA4Q13772 614 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 DPH6Q7L8W6 267 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 METTL23Q86XA0 190 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 NME7Q9Y5B8 376 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 LRRN2O75325 713 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 KRT13P13646 458 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 HOXA9P31269 272 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ADCY1Q08828 1119 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 BIRC3Q13489 604 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 TRPC3Q13507 836 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ATAT1Q5SQI0 421 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 RTL10Q7L3V2 364 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 TMEM86AQ8N2M4 240 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 SPATA18Q8TC71 538 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CEP63Q96MT8 703 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 NOTCH4Q99466 2003 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 PHACTR2O75167 634 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CPB1P15086 417 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 MTHFRP42898 656 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 MLKLQ8NB16 471 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 TAS1R2Q8TE23 839 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 PGLYRP2Q96PD5 576 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 PKMYT1Q99640 499 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 MAFFQ9ULX9 164 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 POLIQ9UNA4 740 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 DENND4AQ7Z401 1863 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 BICDL2A1A5D9 508 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 MTMR11A4FU01 709 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DRAP01903 254 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 POU2F2P09086 479 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 LMO2P25791 158 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 GTF2H1P32780 548 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 NLRP12P59046 1061 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 LIN9Q5TKA1 542 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ACBD6Q9BR61 282 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CYP4F11Q9HBI6 524 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 RWDD2AQ9UIY3 292 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CCL16O15467 120 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 TACC1O75410 805 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 ASS1P00966 412 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 FAM163BP0C2L3 166 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CDR1P51861 262 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CCDC142Q17RM4 750 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 SEMA4DQ92854 862 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 SLC35C1Q96A29 364 aa23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
SYF2-201ENST00000236273 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms