RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.37■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 AQP4P55087 323 aa22.36■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 ANO3Q9BYT9 981 aa22.36■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 VPS11Q9H270 941 aa22.36■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 VILLO15195 856 aa22.36■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 KLC3Q6P597 504 aa22.36■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.36■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.35■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.35■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.35■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 GPAMQ9HCL2 828 aa22.34■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 TTC17Q96AE7 1141 aa22.34■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 ITGB4P16144 1822 aa22.33■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 GJC1P36383 396 aa22.33■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 NOVP48745 357 aa22.33■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 ITGA9Q13797 1035 aa22.33■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 EFHC2Q5JST6 749 aa22.33■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.33■■□□□ 1.17
ODC1-201ENST00000234111 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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ODC1-201ENST00000234111 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.33■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 SMIM18P0DKX4 95 aa22.33■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 SNHG28P0DPA3 235 aa22.33■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 CDK4P11802 303 aa22.33■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 PEX2P28328 305 aa22.33■■□□□ 1.16
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ODC1-201ENST00000234111 CBX3Q13185 183 aa22.33■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 MTMR2Q13614 643 aa22.33■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.33■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.33■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.33■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.33■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 PARVGQ9HBI0 331 aa22.33■■□□□ 1.16
ODC1-201ENST00000234111 S100A14Q9HCY8 104 aa22.33■■□□□ 1.16
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