RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 FBXL13Q8NEE6 735 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC25A39-201ENST00000225308 TAF4BQ92750 862 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC25A39-201ENST00000225308 CASP10Q92851 521 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC25A39-201ENST00000225308 SEMA4DQ92854 862 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC25A39-201ENST00000225308 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC25A39-201ENST00000225308 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC25A39-201ENST00000225308 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SLC25A39-201ENST00000225308 COQ4Q9Y3A0 265 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC25A39-201ENST00000225308 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA31D3P0C874 917 aa23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA18Q8TC71 538 aa23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 MMS19Q96T76 1030 aa23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 THEGQ9P2T0 379 aa23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 POLIQ9UNA4 740 aa23.33■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 OR6C75A6NL08 312 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 GABRDO14764 452 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ABLIM3O94929 683 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 SRGAP2BP0DMP2 458 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 TNNC1P63316 161 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 OSTM1Q86WC4 334 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM209Q96SK2 561 aa23.32■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.326e-7■■■■■ 51.4
SLC25A39-201ENST00000225308 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.328e-7■■□□□ 11.8
SLC25A39-201ENST00000225308 PMM2O15305 246 aa23.31■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 OR4Q2P0C623 313 aa23.31■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ARPP19P56211 112 aa23.31■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNH2Q12809 1159 aa23.31■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.31■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.31■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 SYCE2Q6PIF2 218 aa23.31■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.31■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.31■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 RAB20Q9NX57 234 aa23.31■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 HCRTO43612 131 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 TACC1O75410 805 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 CLSTN1O94985 981 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 CPB1P15086 417 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 SMRP1Q8NCR6 262 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 DZANK1Q9NVP4 752 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ASPAP45381 313 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 MYL7Q01449 175 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 MYL5Q02045 173 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 CLUL1Q15846 466 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 NME7Q9Y5B8 376 aa23.3■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 VNN2O95498 520 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ATF2P15336 505 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 LHX1P48742 406 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 GPR17Q13304 367 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 NCAPHQ15003 741 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 CDKAL1Q5VV42 579 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 TPGS2Q68CL5 300 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ACBD6Q9BR61 282 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 SDCBP2Q9H190 292 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 PTPRDP23468 1912 aa23.29■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 P4HA2O15460 535 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 RFPL2O75678 378 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 P4HA1P13674 534 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 LMO2P25791 158 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 RAP1GAPP47736 663 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 CDH8P55286 799 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 LEXMQ3ZCV2 418 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 BCO2Q9BYV7 579 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 FANCLQ9NW38 375 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 DPP7Q9UHL4 492 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 CD207Q9UJ71 328 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC25A39-201ENST00000225308 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.28■■□□□ 1.32
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