RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 GRID1Q9ULK0 1009 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 DPPA5A6NC42 116 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 EGFRP00533 1210 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 PEX19P40855 299 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 MCL1Q07820 350 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 C4orf50Q6ZRC1 276 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 CENPUQ71F23 418 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 CLNKQ7Z7G1 428 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 LDHDQ86WU2 507 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 TM9SF1O15321 606 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC16A4O15374 487 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 OCRLQ01968 901 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 CTC1Q2NKJ3 1217 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 EFHC2Q5JST6 749 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF449Q6P9G9 518 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 SV2AQ7L0J3 742 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 ALLCQ8N6M5 410 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 SPOCK2Q92563 424 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 TEPSINQ96N21 525 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 YIPF3Q9GZM5 350 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 TJP3O95049 919 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPN7P35236 360 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 PEX3P56589 373 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 UBXN2AP68543 259 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 CYP24A1Q07973 514 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC1A5Q15758 541 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 C4orf19Q8IY42 314 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 LRCH1Q9Y2L9 728 aa24.09■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 NVLO15381 856 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 DHX15O43143 795 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 MUM1Q2TAK8 710 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC30A9Q6PML9 568 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 PCGF5Q86SE9 256 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF333Q96JL9 665 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 VPS11Q9H270 941 aa24.08■■□□□ 1.45
ANKRD54-201ENST00000215941 DNAJC6O75061 913 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 CBX6O95503 412 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 PHBP35232 272 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 PTGER2P43116 358 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC38Q5VT99 294 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 LVRNQ6Q4G3 990 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM136AQ96C01 138 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 TSC22D3Q99576 134 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 BTBD10Q9BSF8 475 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 ASB3Q9Y575 518 aa24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 ITGB5P18084 799 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 TAS2R40P59535 323 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 MXRA7P84157 204 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 AP1ARQ63HQ0 302 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 MFN1Q8IWA4 741 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.445e-8■■■■■ 122.9
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 GSTA2P09210 222 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 SKIP12755 728 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 HSD17B4P51659 736 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 MAMLD1Q13495 774 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 C4orf33Q8N1A6 199 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 TBC1D22BQ9NU19 505 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 ENTPD5O75356 428 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 TGDSO95455 350 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 ARSEP51690 589 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 MICALL2Q8IY33 904 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 ZFAND2BQ8WV99 257 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF148Q9UQR1 794 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 TSHRP16473 764 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 GARTP22102 1010 aa24.05■■□□□ 1.44
ANKRD54-201ENST00000215941 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms