RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gyg1Q9R062 333 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sgk1Q9WVC6 431 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Anapc7Q9WVM3 565 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp6v1c1Q9Z1G3 382 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam205a1D3YZF6 1314 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trip11E9Q512 1976 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AspgA0JNU3 564 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prdm12A2AJ77 365 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4846B2RWH8 538 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc170D3YXL0 722 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mmp13P33435 472 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vamp7P70280 220 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tarbp2P97473 365 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sox10Q04888 466 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pou6f1Q07916 301 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdlim7Q3TJD7 457 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fdxacb1Q3UY23 622 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm14685Q52KH6 695 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc9b2Q5BKR2 547 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp1r13lQ5I1X5 824 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rap1gap2Q5SVL6 712 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NostrinQ6WKZ7 506 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glra2Q7TNC8 452 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam117aQ7TNF9 451 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vat1lQ80TB8 417 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Impg2Q80XH2 1243 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q80ZQ3 298 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rcn2Q8BP92 320 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp37Q8C0R0 979 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Apol7cQ8C6E1 369 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc18a1Q8R090 521 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankef1Q9D2J7 775 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem79Q9D709 391 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sucla2Q9Z2I9 463 aa6.96□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tldc2A2ACG1 198 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam155bA2BDP1 471 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc63A6H694 637 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gcnt4E9Q649 455 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PigrO70570 771 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Axin2O88566 840 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01734 135 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mcpt4P21812 246 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrkchP23298 683 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TxkP42682 527 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CtshP49935 333 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsd17b2P51658 381 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Epas1P97481 874 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mark3Q03141 753 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GsapQ3TCV3 858 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gsdmc4Q3TR54 480 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prpf38bQ80SY5 542 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gjc2Q8BQU6 440 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plcb4Q91UZ1 1175 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arl8bQ9CQW2 186 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Toe1Q9D2E2 511 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem206Q9D771 350 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gon4lQ9DB00 2260 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fgf15O35622 218 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Anxa8O35640 327 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab20P35295 233 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 VcpQ01853 806 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 OsbpQ3B7Z2 805 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gxylt1Q3UHH8 404 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifnl2Q4VK74 193 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Shroom1Q5SX79 823 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xlr3cQ61806 226 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spa17Q62252 149 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnk18Q6VV64 394 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B4galnt4Q766D5 1034 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Camta2Q80Y50 1208 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nipa1Q8BHK1 323 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sugp1Q8CH02 643 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif2b5Q8CHW4 717 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vps37bQ8R0J7 285 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 McmbpQ8R3C0 642 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nr3c2Q8VII8 978 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olig1Q9JKN5 260 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Txnrd2Q9JLT4 524 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cetn2Q9R1K9 172 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Robo3Q9Z2I4 1366 aa6.95□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm16430A6X8J1 155 aa6.94□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zc3h7aE9PWW6 970 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tekt5G5E8A8 557 aa6.94□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10436L7N1Y3 520 aa6.94□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stra6O70491 670 aa6.94□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klf1P46099 358 aa6.94□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PklrP53657 574 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.2 ms