RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W WWM1P43582 211 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W RSM10Q03201 203 aa3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W AVO2Q04749 426 aa3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YKR104WP0CE69 306 aa3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W CDC50P25656 391 aa3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W ARO4P32449 370 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W MNL1P38888 796 aa3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W MOB2P43563 287 aa3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W MGA1P53050 456 aa3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YGL262WP53054 175 aa3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W BRR6P53062 197 aa3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W VPS28Q02767 242 aa3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W CTR3Q06686 241 aa3.95□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W TRP1P00912 224 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W OPI3P05375 206 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W TOA2P32774 122 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YBL059WP34224 193 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W UPS2P35200 230 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YKL071WP36086 256 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W UMP1P38293 148 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W OST3P48439 350 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W NDE2Q07500 545 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W VPS68Q12016 184 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W MCT1Q12283 360 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W CDC28P00546 298 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W HHF1P02309 103 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data3.94□□□□□ -1.78not detected
PRD1YCL057W YOR062CP36025 268 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YPI1P43587 155 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YLR152CP54072 576 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YCT1Q12235 531 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YLR118CQ12354 227 aa3.94□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data3.93□□□□□ -1.78not detected
PRD1YCL057W QCR2P07257 368 aa3.93□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W CTA1P15202 515 aa3.93□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W FIG1P38224 298 aa3.93□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YEA4P40004 342 aa3.93□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W PET191Q02772 108 aa3.93□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YDR286CQ05530 114 aa3.93□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YDR262WQ12331 272 aa3.93□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W BGL2P15703 313 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W PPA2P28239 310 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W ARO2P28777 376 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W EHD3P28817 500 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W MRPL15P36523 253 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W PHS1P40857 217 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W FLC3P53121 802 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W AQR1P53943 586 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W FSH2Q05015 223 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W COA6Q3E846 104 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W MRPS9P38120 278 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W NSA2P40078 261 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YNR066CP53752 436 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W THI74Q04083 370 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W FYV7Q12247 151 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W IZH2Q12442 317 aa3.92□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YLL053CP0CD98 152 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W PAU19P0CE85 124 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W PAU21P0CE86 164 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W PAU22P0CE87 164 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W ARF1P11076 181 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W PAU3P25610 124 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W DEG1P31115 442 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YBR096WP38256 230 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W TRS20P38334 175 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W SPG5P42933 373 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W PAU5P43575 122 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YMR082CQ04276 118 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W ATG5Q12380 294 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W RAX2Q12465 1220 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W COA2Q3E823 68 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W MIR1P23641 311 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W MNS1P32906 549 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W GPX1P36014 167 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W SLM6P38343 150 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YBR292CP38357 123 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W MED6P38782 295 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W SUR2P38992 349 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W GLC8P41818 229 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W YFR054CP43622 192 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W RNH201P53942 307 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W NAT5Q08689 176 aa3.91□□□□□ -1.78
PRD1YCL057W POM33Q12164 279 aa3.91□□□□□ -1.78
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