RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 DUOXA2Q1HG44 320 aa24.13■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.13■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 MAFFQ9ULX9 164 aa24.13■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 SCN1AP35498 2009 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 EXOC3O60645 756 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 RBP5P82980 135 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 PTPN21Q16825 1174 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 TCEAL8Q8IYN2 117 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 THEM5Q8N1Q8 247 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 EDAQ92838 391 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 INTS13Q9NVM9 706 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 POU2F2P09086 479 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 FSHRP23945 695 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 ZXDAP98168 799 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 SORCS3Q9UPU3 1222 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 MYO10Q9HD67 2058 aa24.11■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 RHOBTB3O94955 611 aa24.11■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 CYP11A1P05108 521 aa24.11■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 TNNI1P19237 187 aa24.11■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 MYBPC2Q14324 1141 aa24.11■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 WDR49Q8IV35 697 aa24.11■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.11■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 LRFN3Q9BTN0 628 aa24.11■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 SEC24AO95486 1093 aa24.1■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 ASGR2P07307 311 aa24.1■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 GPR17Q13304 367 aa24.1■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 MTMR3Q13615 1198 aa24.1■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.1■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 ELMOD1Q8N336 334 aa24.1■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 C11orf16Q9NQ32 467 aa24.1■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 INSL5Q9Y5Q6 135 aa24.1■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 PDXKO00764 312 aa24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 OR4Q2P0C623 313 aa24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 CYP24A1Q07973 514 aa24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 BFSP1Q12934 665 aa24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 MYO1EQ12965 1108 aa24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 KCNB1Q14721 858 aa24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 PSMD6Q15008 389 aa24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 WSCD1Q658N2 575 aa24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 BORCS6Q96GS4 357 aa24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 DENND4AQ7Z401 1863 aa24.09■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 PRR33A8MZF0 331 aa24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 HUS1O60921 280 aa24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 NTHL1P78549 312 aa24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 FAM84AQ96KN4 292 aa24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 MYADMQ96S97 322 aa24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SYT6-210ENST00000641643 PTPN2P17706 415 aa24.08■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 IQCEQ6IPM2 695 aa24.08■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 TRIM67Q6ZTA4 783 aa24.08■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 UBALD2Q8IYN6 164 aa24.08■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 CGRRF1Q99675 332 aa24.08■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa24.08■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 IGSF9Q9P2J2 1179 aa24.08■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 SIX4Q9UIU6 781 aa24.08■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 SNX9Q9Y5X1 595 aa24.08■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 PTPRJQ12913 1337 aa24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 LAMP2P13473 410 aa24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 SIGLEC14Q08ET2 396 aa24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 CXorf38Q8TB03 319 aa24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 HPDLQ96IR7 371 aa24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 KCNK12Q9HB15 430 aa24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 RMND1Q9NWS8 449 aa24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.07■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 DOCK6Q96HP0 2047 aa24.06■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 TWF1Q12792 350 aa24.06■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 DUSP4Q13115 394 aa24.06■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 PLD1Q13393 1074 aa24.06■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 PNOCQ13519 176 aa24.06■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.06■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.06■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 TMEM209Q96SK2 561 aa24.06■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.06■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.06■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SYT6-210ENST00000641643 MTMR11A4FU01 709 aa24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms