RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	DCLK3	Q9C098	648 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MAPK13	O15264	365 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBED4	O75132	1171 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TCF4	P15884	667 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TNNI1	P19237	187 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ARSE	P51690	589 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TAS2R40	P59535	323 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SPARCL1	Q14515	664 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CLUL1	Q15846	466 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM160B2	Q86V87	743 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ATL2	Q8NHH9	583 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FBXO41	Q8TF61	875 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	UCMA	Q8WVF2	138 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ACCS	Q96QU6	501 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	BATF3	Q9NR55	127 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SGK1	O00141	431 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT4	P19013	534 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ADRA1D	P25100	572 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RFC5	P40937	340 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	GAD2	Q05329	585 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MTMR1	Q13613	665 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	VPS52	Q8N1B4	723 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PICK1	Q9NRD5	415 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	WHRN	Q9P202	907 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRD1	A4D1F6	860 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	VWA5A	O00534	786 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TKFC	Q3LXA3	575 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	KIFAP3	Q92845	792 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CYTH2	Q99418	400 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TSC22D3	Q99576	134 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRC19	Q9H756	370 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ARMCX1	Q9P291	453 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	GGPS1	O95749	300 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	LINGO3	P0C6S8	592 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	GNAT1	P11488	350 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RCN2	Q14257	317 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RCN1	Q15293	331 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF220	Q5VTB9	566 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CD101	Q93033	1021 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PEX11A	O75192	247 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP4A	P20648	1035 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CALB2	P22676	271 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SSTR1	P30872	391 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	BACE1	P56817	501 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CDR2	Q01850	454 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC125	Q86Z20	511 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TTC17	Q96AE7	1141 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT36	O76013	467 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CCNE2	O96020	404 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	IVD	P26440	423 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CETN2	P41208	172 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	NRL	P54845	237 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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