RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 STK39Q9UEW8 545 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM189A1O60320 539 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 GALTP07902 379 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CLTAP09496 248 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CNPP09543 421 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 ENPEPQ07075 957 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 MED15Q96RN5 788 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 THAP9Q9H5L6 903 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 STARD6P59095 220 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 SHDQ96IW2 340 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 MYADMQ96S97 322 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 VN1R3Q9BXE9 311 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXQ1Q9C009 403 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 IPPQ9Y573 584 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CLUHO75153 1309 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF233A6NK53 670 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 BECN2A8MW95 431 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 YARSP54577 528 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 USP37Q86T82 979 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 ACAP3Q96P50 834 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 DOCK8Q8NF50 2099 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM208BQ5VWN6 2430 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 LAMTOR5O43504 91 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 LILRB3O75022 631 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 TPM4P67936 248 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 IQCB1Q15051 598 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 SURF1Q15526 300 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP135Q66GS9 1140 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CD302Q8IX05 232 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 SAAL1Q96ER3 474 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 CBX8Q9HC52 389 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 MAN1C1Q9NR34 630 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D13Q9NVG8 400 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 DPP7Q9UHL4 492 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-214ENST00000592483 IL18RAPO95256 599 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 ITGA4P13612 1032 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 TGM1P22735 817 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 BCO2Q9BYV7 579 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 EPC1Q9H2F5 836 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 ANHXE9PGG2 379 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRN2O75325 713 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 AKAP3O75969 853 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 LAMP2P13473 410 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 ACOT2P49753 483 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 SPAG1Q07617 926 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 NCAPHQ15003 741 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 GLB1LQ6UWU2 654 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB44Q8NCP5 570 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 ADRB2P07550 413 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT13P13646 458 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC11A1P49279 550 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-214ENST00000592483 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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